人体胃肠道中寄居着千余种、总数有十万亿之多的微生物菌群，如此庞大规模的微生物菌群对人体所摄取的各营养物质的消化、吸收等代谢过程起到了重要作用。常年饮食偏好（如喜好吃糖类食物、油脂类食物、蛋白类食物等）等生活饮食习惯，容易引起胃肠道中某一类或某几类微生物菌群以食物中的某种或某几种营养物质（脂质、糖、蛋白质等）为反应底物不断进行降解代谢，并利用其代谢过程中所产生的物质与能量来完成自身菌群的繁殖、生长、扩张等各种生命活动，经年累积时会导致相关胃肠道菌群过度繁殖而引起数量增多、规模扩大以至失衡及移位状态，往往会突破寄居人体、相生相伴、和谐共生等从属的边界。

胃肠道微生物菌群会把食物中的大分子营养物质降解成各种小分子物质，如脂肪会被降解成短链脂肪酸、甘油三酯、乳糜微粒等，淀粉、多糖等物质会被降解成葡萄糖、果糖等单糖分子，蛋白质、多肽会被降解成氨基酸等物质，降解生成的各种小分子营养物质很容易被人体的肠系膜细胞所吸收，此过程称为人体的被动吸收过程。胃肠道微生物菌群处于失衡及移位状态时，失衡及移位的微生物菌群会通过分泌相关胞外酶等发出“错误”应激反应信息，导致人体和新陈代谢相关的“应激反应”机制启动，进而导致人体不自觉摄入更多符合个人饮食偏好的食物，会容易导致人体在一段时间内出现摄取营养物质过多现象，即引起被动吸收过多。被动吸收过多叠加人体自主控制的由各消化器官、消化组织分泌的消化酶参与人体正常的基础代谢所进行的消化吸收即主动吸收过程时，会导致人体消化吸收营养物质过剩即引发营养代谢紊乱综合症状。

营养代谢过剩属于营养代谢不平衡的一种，营养代谢不平衡还包括营养代谢不良（营养缺乏）症状。